Grazie alla presenza di elementi genetici mobili (MGE), i batteri possono aumentare la tolleranza a vari fattori di stress ambientale acquisendo geni accessori. Tra questi, gli elementi genetici extracromosomici (ECE) sono rimasti a lungo inesplorati negli studi metagenomici, che si basano soprattutto su tecnologie di sequenziamento a lettura corta poco efficaci nell’assemblare regioni genomiche complesse. Un’ulteriore criticità è la presenza, nella saliva, dell’85–95% di DNA di origine umana, rendendo difficile recuperare sequenze batteriche di alta qualità.
In uno studio pubblicato su Nature Communications, Yutaka Suzuki e colleghi dell’Università di T...